In The Fox Experiment, je zult je eigen vossen fokken. In elke ronde kies je een paar vossenouders met bepaalde eigenschappen. Je krijgt die specifieke trait-dobbelstenen, rolt ze en probeert ze te verplaatsen om complete trait-symbolen te maken die je vervolgens afvinkt op je pupkaart. Je krijgt dan trait-tokens afhankelijk van hoeveel traits je hebt afgevinkt die je gebruikt om tracks op je persoonlijke spelbord te upgraden.

Aan het einde van de ronde worden de vorige generatie vossen vervangen en worden alle nieuwe pups verplaatst naar de kennel - wat betekent dat ze kandidaten worden om in de volgende ronde als ouders te worden gekozen. Het spel eindigt na 5 rondes en je krijgt punten door de sponsors (bonussen voor eindscore), studies die zijn voltooid (persoonlijke speldoelen), als je ooit de prijs voor de vriendelijkste vos hebt gewonnen, upgrades op je persoonlijke spelbord en extra tokens. De speler met de meeste punten wint!